Một số hiện tượng xảy ra tại bể sinh học và bể lắng sinh học như: bung bùn, lên bùn, bọt và váng nổi, bùn mịn, bùn vón cục,…

Cũng do tính chất ít biến động của môi trường phản ứng: cơ chất, chất dinh dưỡng cho vi sinh vật thường rất thấp (để phù hợp với tiêu chuẩn thải) nên dễ xuất hiện hiện tượng bùn khó lắng (bulking) do sự phát triển quá mức của vi khuẩn dạng sợi.

Công nghệ FBR (Fixed Bed Reactor) là một công nghệ được ứng dụng để xử lý các chất hữu cơ hòa tan có trong nước thải cũng như một số chất vô cơ như H2S, sunfit, ammonia, nitơ…

Chlorine là một chất hóa học có tác dụng oxy hóa mạnh và sát khuẩn vì thế clorin được sử dụng trong tẩy trắng và khử trùng nước. Chlorine được dùng phổ biến trong thủy sản,dệt nhuộm, xử lý nước cấp và nước thải, nước bể bơi